イラレはver.9以降からオブジェクトに透明度を設定できる様になりました。

さらに、オブジェクトの描画モードも設定できる様になりました。Photoshopでおなじみに「乗算」とか「スクリーン」とか「覆い焼き」とかのアレです。

コレでいっきに表現度が広がったと思います。オブジェクトやアピアランスは重ね合わせる事が可能なのですもの。　
ハイライトやシャドウも楽に入れられる様になって、だんだんフォトショップ要らずになってゆくのですよね。

ちなみにカワココのイラレには各透明度に20%刻みでショートカットが割り振ってあります。
shift+2 = 20% / shift+4 = 40% / shift+6 = 60% / shift+8 = 80% てな具合。使用頻度が高い「通常」「乗算」と「スクリーン」も同様です。